Black Jack é um médico “não registrado” com um nebuloso e misterioso passado. Ele trabalha com sua pequena assistente Pinoko (que tem uma enorme paixão pelo médico), lidando com casos médicos não muito conhecidos, que podem ser estranhos, perigosos ou desconhecidos. Mas ele é um gênio e pode salvar a vida de quase todos os seus pacientes (isto é, desde que tenham dinheiro para isso), e é conhecido por muitos em todo o mundo, especialmente por aqueles da área de medicina e ciência. Ele é um homem de ciência, e não acredita muito até que ele tenha visto com seus próprios olhos, mas muitas vezes é surpreendido pelo amor e pela natureza, que frequentemente prevalece sobre a ciência em que ele baseia sua vida.
