Yomogi Asanaka, um aluno do primeiro ano da Escola Secundária Fujiyokidai, vivia sua vida normal até se deparar com um misterioso rapaz caído pelo caminho que dizia se chamar Gauma e ser um “usuário de Kaiju”. Achando tudo aquilo muito estranho, Yomogi tenta se afastar o máximo possível daquela pessoa, mas, subitamente, aparece um enorme Kaiju onde ambos estão acompanhados de Yume Minami, uma garota que todos estranham pelo jeito de se comportar. Ali perto também estão Koyomi Yamanaka e Chise Asukagawa que também não sabiam de nada do que estava acontecendo, até todos eles serem arrastados para uma luta entre o robô gigante Dynazenon e o Kaiju misterioso.
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